奥特战士与贝利亚之间的战斗被地球人奉为传说一直流传了下来在六年前的地球上曾出现过怪兽，那场混乱平息之后，人们一直过着和平的日子。主人公朝仓陆从小不知道自己的双亲是谁。他在小时候遇见了佩嘉萨星人——佩嘉，他目前住在星云庄内，是一位崇拜英雄的普通青少年。某天，六年前的怪兽再次出现！星云庄被它肆意践踏，小陆和佩嘉不知该逃往何处，此时他们意外地发现了藏在地底的秘密基地。从基地的莱姆那里拿到了“奥特胶囊”的小陆，变身成了捷德奥特曼！这位奥特战士成功击退了怪兽，但他的外形却酷似贝利亚。在那之后，怪兽们接二连三地出现，它们的目标都是能源体“利特鲁之星”。这一连串的事件背后隐藏着贝利亚的阴谋，察觉到这一点的赛罗奥特曼来到了地球。继承了贝利亚遗传基因的小陆，他与命运抗争，想要成为真正的英雄，战斗就此展开！